Geoestatística no R
Conheça a série de artigos “Geoestatística no R”: lista completa ao final do artigo
Esta série tem por objetivo apresentar uma breve introdução à linguagem R e, principalmente, o uso dos pacotes geoestatísticos disponíveis em R com tutoriais e exemplificações. A linguagem R é um software livre com licença GNU (General Public License) que integra na sua estrutura uma infinidade de pacotes, sendo esta a forma como o R aumenta a sua capacidade e versatilidade. A teoria geoestatística não será abordada em profundidade nestas lições, pois essas têm a finalidade da prática no R.
Nestas lições serão abordados os pacotes geoestatísticos gstat e geoR, bem como pacotes para modelagem da dependência espacial, tais como: spatial, sp, rgdal, mapview, maptools e rgdal, que permitem ao usuário uma análise espacial de dados georreferenciados de forma rápida e confiável.
Além disso, será utilizado o pacote ggplot2, que é uma biblioteca de rotinas gráficas, que permitem criar gráficos simples ou complexos, com alta qualidade.
O que é o R?
R é uma linguagem de programação especialmente dedicada à análise estatística e gráfica dos dados, com licença GNU. A primeira versão do R foi desenhada por Ross Ihaka e Robert Gentleman no ano de 1993, membros da Universidade de Auckland (Nova Zelândia) do departamento de estatística. O R é um software que é considerado a versão gratuita do programa informático S, que foi construído em 1976 pelos laboratórios Bell.
Como instalar o R: tutorial
O primeiro passo para a instalação do R é acessar o site oficial de R-project: https://www.r-project.org/
2. Selecione a localização da preferência ou de acordo com o local onde você está localizado, por exemplo Brasil – São Paulo:
O R pode ser instalado em sistemas operacionais como Windows, Linux, ou MacOS X. Uma vez selecionada a plataforma, uma nova tela é aberta, na qual clicamos na opção base:
3. Em seguida fazemos Download do R. É recomendável baixar a versão mais recente:
O procedimento de instalação do R é automático, uma vez instalado, o ícone do programa aparecerá na área de trabalho.
Veja também
Console e editor R:
A primeira janela que aparece quando abrimos o R é chamada de console, mostrando a versão mais recente de R, o prompt (>) e é indicado que o programa está pronto para escrever comandos.
Para editar um código em R, pode ser escrito a partir do console ou através do editor, chamado script.
No console R, você pode trabalhar diretamente para a execução do código, pressione a tecla “Enter”, o console nos dá o resultado, por exemplo:
Os cursores de deslocamento são muito úteis no console, a seta para cima ↑ acessa os comandos anteriores, a seta para baixo ↓ para o próximo comando e as setas esquerda ← e direita → movem o cursor na mesma linha para corrigir, modificar ou adicionar novas propriedades.
Para entrar no editor ou script do R, seguimos os seguintes passos:
Para mais comodidade ao usuário, o R permite trabalhar com o editor, escolhendo as opções seguintes:
Quando usamos a tecla # no início de um escrito, o resultado no R é lido como um comentário:
A maneira mais eficiente de trabalhar em R é através do editor. Permite criar códigos mais complexos que podem ser corrigidos, retocados e salvos para continuar em outro momento. Para que o código seja executado, devemos pressionar o ícone de execução ou as teclas CTRL + R conforme a imagem.
Ajuda no R:
Para obter ajuda sobre as funções incorporadas nos pacotes de R, procedimentos ou modelos formais, existem várias alternativas.
Escolhemos a opção de ajuda no menu do R e procuramos funções R (texto), assim, escrevemos a função que procuramos:
Outra maneira de obter ajuda no R é clicar na cosole help(“ggplot2”):
Pacotes no R:
A instalação de pacotes em R pode ser feita de duas maneiras. A primeira maneira é usar o console diretamente. O segundo caminho é selecionar na barra de menu a opção pacotes → instalar pacotes.
Console:
Barra de menus:
Para carregar o pacote instalado, é necessário escrever no console: >library(ggplot2), em cada sessão de trabalho em que você deseja usar.
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Série de tutoriais: Geoestatística no R – veja a lista
Lição 2 – Objetos e estruturas
Lição 3 – Leitura e gravação de dados
Lição 4 – Estrutura gráfica em R
Lição 5 – Uso dos gráficos no R
Lição 7 – Análises descritivas dos dados
Lição 8 – Distribuições discretas
Lição 9 – Distribuições contínuas
Lição 11 – ggplot2 (histograma)
Lição 13 – ggplot2 (scatterplot)
Lição 15 – ggplot2 (série temporal)
Lição 16 – ggplot2 (diagrama de área)
Lição 17 – ggplot2 (diagrama circular)
Lição 22 – Fenômeno isotrópico
Lição 23 – Modelos teóricos de variogramas
Lição 24 – Fenômeno isotrópico ou anisotrópico?
Lição 25 – Ajuste do variograma experimental com anisotropia
Lição 26 – Ajuste do variograma experimental omnidirecional
Lição 28 – Ajuste do variograma experimental com GeoR
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